Ja’far Umar Thalib memang magnet bagi warga muslim Ambon. Dua tahun terakhir, nama ini menjadi pahlawan buat mereka. Pemujaan itu terjadi sejak anggota Laskar Jihad yang dipimpinnya secara bergelombang masuk ke daerah yang tengah dilanda konflik antara kelompok Islam dan kelompok Kristen tersebut. Dimulai angkatan pertama, berjumlah 29 orang, yang berangkat dengan menumpang kapal Pelni pada 29 April 2000. Kini jumlah anggota laskar ini di Ambon dan sekitarnya, menurut klaim mereka, sekitar 3.000 orang.